花毛茛是有种子的，它的种子为黑色球状颗粒物，比较饱满，种子体型十分小巧。花毛茛种子为成熟时，会在雌蕊柱顶上密切排列生成青色聚合的果子。当成熟后摘下来聚合果，将外皮除去，里头便是花毛茛的种子。想要在开花过后获得种子的话，就不要将凋谢的花朵剪去。在果子从原先的青色变色黄色过后，就表明种子成熟了，这时摘下来后就可以取种了。

播种花毛茛种子，应挑选秋季，这时温度不会再炎热降至了20℃以内，适宜花毛茛种子发芽。在播种花毛茛种子前，需要开展催芽处理。需要将优良的种子用纱布包好，放进温水中浸泡24个小时。在播种花毛莨时，将种子匀称铺在土壤表层，花毛莨喜爱松软，富饶的酸性土壤，可以用园土，沙土，动物粪便混和，有助于种子发芽。在种子的表层上，也能够铺上1层薄薄的培养土，起着保温保湿的作用。